北京基因组所(国家生物信息中心)杨运桂研究员应邀系统总结和展望RNA修饰与发育研究
克日,南宫娱乐(国家生物信息中心)杨运桂研究员应邀在国际期刊Accounts of Chemical Research 揭晓题为“Emerging roles of RNA methylation in development”的综述文章,总结了RNA甲基化修饰在种种发育历程中的功效和调控机制。
随着高通量测序手艺的快速生长,在种种RNA上已发明了凌驾170种化学修饰类型,这些化学修饰在细胞以致生物体的运气调控方面施展着主要作用,普遍加入了主要的心理和病理历程。近期,单细胞RNA m6A测序手艺的开发并应用于小鼠胚胎干细胞和早期胚胎发育历程中,进一步证实晰RNA m6A修饰在调控干细胞和胚胎发育历程中施展的主要调控作用。为更好地明确RNA甲基化修饰在干细胞增殖、分解和发育历程中的要害作用,该综述文章围绕当下研究较多的4种RNA甲基化修饰,包括N6-甲基腺嘌呤(m6A)、5-甲基胞嘧啶(m5C)、N1-甲基腺嘌呤(m1A)和N7-甲基鸟嘌呤(m7G),总结了RNA修饰的检测手艺、调控卵白及其在发育中的功效,重点叙述了近年来RNA甲基化加入调控干细胞增殖、神经爆发、胚胎发育、动物生殖以及植物生长等种种发育历程的研究希望。
高通量测序手艺的生长为破译RNA甲基化修饰的功效涤讪了坚实的基础。该综述文章围绕测序原理、处置惩罚条件、区分率以及定量方法等手艺特征举行了总结,并强调了单细胞水平RNA甲基化修饰测序的手艺需求。RNA甲基化具有动态可逆性特征,由甲基转移酶(writer)和去甲基化酶(eraser)配合调控。连系卵白(reader)可识别RNA甲基化,从而介导RNA的转录、可变剪接、核转运、降解和翻译等代谢,进而影响种种心理历程。该综述文章系统地梳理了其研究团队和国际偕行发明的RNA甲基化修饰的种种调控卵白及其细胞定位、底物信息以及相关调控功效等,并提出进一步探索新发明调控因子所加入功效调控的可能性。
别的,综述重点归纳了发育历程中,干细胞和发育细胞及组织中的RNA甲基化修饰及其调控因子施展的要害调控作用及影响。针对差别发育类型,强调RNA甲基化失调与发育障碍相关,影响干细胞的多能性和增殖、神经爆发、动物的生殖和胚胎发育以及植物的生长和应激反应等。突出RNA甲基化修饰作为一类主要的表观修饰类型,在重大生物学历程中的主要调控职位。相识RNA甲基化的作用有助于深入探讨发育以及其相关疾病潜在的治疗战略,具有辽阔的研究远景。
最后,综述基于现在RNA甲基化修饰的检测手艺和功效研究,指呈现在仍缺乏高通量、单细胞区分率以致空间水平的RNA甲基化测序手艺,并讨论了单细胞和空间RNA修饰测序手艺对精准剖析发育历程中RNA表观修饰调控功效的支持作用,展望了RNA表观层面的单细胞和空间组学测序手艺的生长将在更高区分率和多组学维度上拓展发育和疾病等领域的研究,进一步提出多组学同步检测和剖析关于深入探索RNA甲基化调控发育和疾病等重大生命历程的分子机制,具有主要意义并提供了新的研究维度。

RNA甲基化修饰普遍加入干细胞增殖、分解和种种发育历程






