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基因组所肩负的南宫娱乐重点安排特支项目“南海部分海区主要微生物类群基因组多样性起源研究”完成结题验收

  2016815日 ,南宫娱乐前沿科学与教育局在北京组织召开了南宫娱乐重点安排特支项目“南海部分海区主要微生物类群基因组多样性起源研究”结题验收会。验收专家组由来自中科院植物所、微生物所、遗传发育所、首都师范大学、山东大学的7位营业专家 ,以及来自中国生物手艺生长中心的财务专家组成。中科院植物所洪德元院士任专家组组长>刍嵊芍锌圃呵把鼐稚蒲Тι蛞愦Τぶ鞒 ,基因组所党委副书记王丽萍加入了聚会。 

  该项目由中科院北京基因组研究所和中科院南海海洋所配合肩负 ,张德兴研究员主持。经由3年的研究 ,项目对从南海差别海域收罗和疏散的10株放线菌、9株链霉菌举行了全基因组测序、拼接和注释 ,并通过泛基因组学和功效基因组学剖析以及较量进化基因组学剖析 ,发明放线菌专属的一些自然产品(如聚酮类、多肽类、醌类等)的代谢途径 ,探讨了海洋链霉菌类群对海洋高盐、低温、寡营养生境的顺应机制;完成34个海洋站位143个样品的16S rDNA测序 ,以及45个样品的宏基因组测序和剖析 ,剖析了南海海洋细菌群落组成与深度、温度、盐度、磷酸盐和硅酸盐等情形因素的关联性 ,探讨了微生物群落和功效特征的动态历程及其转变机制;开发了基于新一代测序手艺的微生物基因组的高效优化拼接要领的GAP PRIE软件 ,以及用于对海量微生物基因组数据举行泛基因组特征剖析的PanGP软件 ,并实现了数据和效果的可视化展示;建设包括南海微生物的海洋微生物组学数据库及网站 ,实现了数据共享与海洋微生物资源的科学普及。项目的完成为以后开发使用海洋微生物资源涤讪了基础 ,同时也增强了对我国南海海区的深入科学研究。 

  专家组认真审阅结题报告 ,听取了项目及课题组的汇报并举行了提问和深入讨论。经评定 ,专家组一致以为该项目很好的完成了既定目的 ,赞成该项目通过验收。专家组体现 ,中科院在2013年头就安排了该项目 ,具有久远战略眼光 ,应继续在已经取得的优势的基础上 ,进一步增强顶层设计 ,组织协调步队 ,充分验展中科院的优势 ,在海洋微生物资源领域研究方面施展更大的作用。

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